Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM1BQ8NB78 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM1BQ8NB78 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM1BQ8NB78 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM1BQ8NB78 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM1BQ8NB78 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM1BQ8NB78 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM1BQ8NB78 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM1BQ8NB78 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms