Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC57Q8N9N7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC57Q8N9N7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms