Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC155Q8N6L0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms