Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
VPS8Q8N3P4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
VPS8Q8N3P4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms