Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC170Q8IYT3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC170Q8IYT3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms