Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC65Q8IXS2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC65Q8IXS2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC65Q8IXS2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC65Q8IXS2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms