Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC103Q8IW40 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC103Q8IW40 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms