Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms