Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
P3H3Q8IVL6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
P3H3Q8IVL6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms