Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms