Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLNKQ7Z7G1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms