Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEGR1Q7Z3B1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms