Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY3Q7L099 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY3Q7L099 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms