Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms