Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFVQ71UI9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms