Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM179Q6ZVK1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM179Q6ZVK1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms