Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LBX2Q6XYB7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX2Q6XYB7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms