Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms