Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF7IPQ6VMQ6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7IPQ6VMQ6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7IPQ6VMQ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms