Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUSD1Q6UWL2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms