Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms