Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5P6

TY4A-H, Transposon Ty4-H Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4A-HQ6Q5P6 TDA11YHR159W 1515 nt5.5□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 CDC4YFL009W 2340 nt5.5□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 ARG82YDR173C 1068 nt5.5□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YER084WYER084W 387 nt5.5□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 ATG27YJL178C 816 nt5.5□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YLR125WYLR125W 411 nt5.5□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 MRPL44YMR225C 297 nt5.5□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 TSR4YOL022C 1227 nt5.5□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 ETR1YBR026C 1143 nt5.5□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 CAF20YOR276W 486 nt5.5□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 ASK10YGR097W 3441 nt5.49□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YHR213WYHR213W 597 nt5.49□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YKL063CYKL063C 504 nt5.49□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YKL177WYKL177W 339 nt5.49□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YAR062WYAR062W 597 nt5.49□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 SEC22YLR268W 645 nt5.49□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 RHO5YNL180C 996 nt5.49□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt5.49□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 UBX3YDL091C 1368 nt5.49□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 BUL1YMR275C 2931 nt5.49□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 PAL1YDR348C 1500 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 MCH4YOL119C 1506 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 SAS10YDL153C 1833 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 RCK2YLR248W 1833 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 ARG4YHR018C 1392 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 RTT106YNL206C 1368 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 SUR2YDR297W 1050 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 MIG3YER028C 1185 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 RRP4YHR069C 1080 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 GVP36YIL041W 981 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YNK1YKL067W 462 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 TRE1YPL176C 2352 nt5.48□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 ASM4YDL088C 1587 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 UBC1YDR177W 648 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 TMA20YER007C-A 546 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 ARC1YGL105W 1131 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 DSE2YHR143W 978 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 EFM4YIL064W 774 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 FMP33YJL161W 543 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 EAF6YJR082C 342 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 MET14YKL001C 609 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 VPH2YKL119C 648 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 RPC37YKR025W 849 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YML047W-AYML047W-A 366 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YSF3YNL138W-A 258 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 YNR071CYNR071C 1029 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 snR10snR10 245 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 ECM23YPL021W 564 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 STP22YCL008C 1158 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 ABF1YKL112W 2196 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 MGS1YNL218W 1764 nt5.47□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 GDB1YPR184W 4611 nt5.46□□□□□ -1.53
TY4A-HQ6Q5P6 HUL4YJR036C 2679 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 PHO13YDL236W 939 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 AAD4YDL243C 990 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 CAP2YIL034C 864 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 APS3YJL024C 585 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 DOA1YKL213C 2148 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YKR011CYKR011C 1062 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YMR130WYMR130W 909 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 BRX1YOL077C 876 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 SYC1YOR179C 567 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YPL185WYPL185W 396 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 MMP1YLL061W 1752 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 BDP1YNL039W 1785 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 KCC4YCL024W 3114 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 AGE1YDR524C 1449 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 STB2YMR053C 2553 nt5.46□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 STE7YDL159W 1548 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 CDC37YDR168W 1521 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YCL065WYCL065W 369 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YDL032WYDL032W 312 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YRA1YDR381W 681 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 NAT2YGR147C 867 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 GCD14YJL125C 1152 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 ASG7YJL170C 630 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 LST8YNL006W 912 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YCL020WYCL020W 1317 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 ACA1YER045C 1470 nt5.45□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 SKM1YOL113W 1968 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YCR022CYCR022C 345 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 RIM1YCR028C-A 408 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 RPL35BYDL136W 363 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 TWF1YGR080W 999 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 YJR087WYJR087W 351 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 RPS1AYLR441C 768 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 CSM4YPL200W 471 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 RFC5YBR087W 1065 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 HRP1YOL123W 1605 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 ASA1YPR085C 1332 nt5.44□□□□□ -1.54
TY4A-HQ6Q5P6 SEG2YKL105C 3399 nt5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.8 ms