Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms