Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO4Q6EEV6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms