Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA3Q6AZY7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms