Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E4F1Q66K89 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms