Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms