Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms