Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf53Q5VUE5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf53Q5VUE5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms