Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR78Q5VTH9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms