Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms