Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LDLRAP1Q5SW96 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms