Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms