Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLE1Q53GS7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLE1Q53GS7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLE1Q53GS7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLE1Q53GS7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLE1Q53GS7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLE1Q53GS7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLE1Q53GS7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLE1Q53GS7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms