Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms