Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CERKLQ49MI3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CERKLQ49MI3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms