Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF3Q496Y0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms