Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB5Q2M3G0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB5Q2M3G0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms