Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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