Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNOP1Q1ED39 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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