Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IMPG1Q17R60 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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