Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FXNQ16595 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FXNQ16595 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FXNQ16595 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FXNQ16595 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FXNQ16595 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FXNQ16595 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FXNQ16595 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FXNQ16595 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FXNQ16595 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FXNQ16595 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FXNQ16595 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FXNQ16595 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FXNQ16595 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FXNQ16595 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FXNQ16595 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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