Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK5Q16478 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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