Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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