Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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