Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MDC1Q14676 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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