Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE4AQ14139 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
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UBE4AQ14139 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
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