Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CUL4BQ13620 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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