Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAE1Q13564 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NAE1Q13564 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms