Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SNTA1Q13424 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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