Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SKP2Q13309 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SKP2Q13309 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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SKP2Q13309 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SKP2Q13309 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SKP2Q13309 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SKP2Q13309 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SKP2Q13309 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SKP2Q13309 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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